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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

贵阳贵安：绿色经济添活力 生态产业强动力******

　　多彩贵州网讯(本网记者 程曦李易淋)“2023年，贵阳贵安将坚持‘生态立市’战略不动摇，统筹好发展与生态、发展与安全，深入践行‘绿水青山就是金山银山’理念，坚定不移走生态优先、绿色发展之路，推动生态产业化和产业生态化，不断拓宽'绿水青山'和‘金山银山’双向转化通道，实现经济社会高质量发展。”1月9日，在贵阳贵安绿色经济新闻发布会上，贵阳市人民政府副市长冉斌介绍。

新闻发布会现场

　　据介绍，2023年，贵阳贵安将高质量打造绿色空间，推动阿哈湖绿核的城市客厅、环湖绿道、湿地公园建设，打造千园之城、千道城市升级版。加快推进重要流域、重点河湖、重要生态功能区以及矿山资源集中开发区生态修复，全面加强野生动植物资源保护，维护生物多样性，提升生态系统功能。坚持“爽爽贵阳”拒绝污染，守牢“绿色门槛”，坚决打好蓝天、碧水、净土、固废治理和乡村环境整治“五大攻坚战”，巩固和提升城乡生态环境质量。

　　依托良好的农林、康养旅游、文化等资源禀赋，贵阳贵安将统筹农文旅一体化发展。推动果蔬、茶叶、食用菌、花卉等特色优势生态农业提质发展，大力发展林菌、林药、林蜂等林下经济和林特产业，打造修文猕猴桃、花小莓、印象硒州等农产品区域公用品牌。充分发挥爽爽贵阳品牌优势，利用好贵阳老城文脉、特色文化、乡村旅游等资源禀赋，创新发展“文化+旅游”“大健康+旅游”“农业+旅游”“教育+旅游”等旅游业态，实施一批康养、旅游融合发展项目，全面盘活闲置低效旅游项目，加快建设全国全域旅游示范区。

　　同时，将着力推动重点产业绿色化、高端化发展。围绕“1+7+1”重点产业领域，加快推动生产方式绿色转型，打响“电动贵阳”“智造贵阳”“无废城市”等经济发展名片，不断提升贵阳贵安经济社会发展的“绿色含量”。以磷化工、铝及铝加工、特色食品为重点，促进磷化工基础产品创新，推动铝及铝加工高端化发展，提升绿色食品产业附加值，推动传统产业转型升级发展。聚焦新能源汽车和电池、装备制造和健康医药等重点领域，做大做强以新能源汽车和电池为双核心的产业集群，加速嵌入式软件产品与电子信息制造、先进装备制造等产业融合创新，加快发展健康医药产业。围绕云服务、数据流通、信创产业，积极发展数字经济。

　　此外，还将大力实施园区循环化改造提升工程，建设贵安为核心的贵阳贵安全域绿色工业园区，推动具备条件的省级以上园区全部实施循环化改造，加快创建国家(省)级绿色园区、循环经济试点园区。积极推进工业园区分布式光伏发电、污染集中处理，开展清镇经济开发区绿色产业示范基地等试点建设。加强工业固废治理，开展工业尾矿库、工业渣场综合整治，深入实施磷化工企业“以渣定产”，推进磷石膏、赤泥等工业固体废物源头减量和综合利用。

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）